十天之后，三叉戟偷偷告诉唐巍：“硬盘保护盒已经找到，里面的硬盘已经取出，运回海神基地，不过硬盘里面录下了什么，现在还不知道，硬盘中的内容，除了团长，谁都不能看。”
唐巍表面上装出高兴的样子，可心中却是惴惴不安，海伦娜再三警告他，不要把海底遗址的见闻告诉任何人，李参谋为了不让东国得到唐巍，甚至不惜付出生命，可是唐巍没有听从警告，不知道会有什么灾难后果。
十五天之后，扶桑国方面一切准备就绪，只等唐巍的伤口完全愈合，就要下水，可就在这天凌晨，鲸鲵号和海龙号突然接到扶桑国地震局消息，海底森林附近海域发生4.7级地震，地震有可能引发强烈海啸，鲸鲵号、海龙号和扶桑国舰队必须立刻驶离当前海域。
这个消息一过来，池田村正的心里就是一颤，海底森林在一片峡谷之中，地震会让峡谷两边的岩体发生滑坡，大量岩石会倾泻到海底森林之上，将那片森林彻底掩埋。
地震影响的不仅仅是海底森林，之前发现的海底遗址也会遭受毁灭性打击，海底遗址位于珊瑚礁下方，地震会摧毁大面积珊瑚礁，令珊瑚礁掩埋在海底遗址之上。
当森林和遗址被掩埋之后，再也没有人能进入其中，因为覆盖在其上的岩石、珊瑚礁可能厚达数百米，在水下几乎没有办法清理。
这座充满了未解之谜的遗址，将永远沉睡在水下，永远不为人知。
池田村正是没有力量与地震抗衡的，只能黯然命令撤退。
中年船长虽然不甘心，可是也没有办法，只能看着舰队和考察船离开，数艘舰船只能暂时返回冲绳岛的港口。
这场地震发生得扑朔迷离，按照之前地质学专家的预估，海底遗址所在海域发生地震的可能性极小，自从有地震记录以来，这片海域就没有发生过地震。
唐巍联想起在复活节岛引发地震的巨型石人，不禁怀疑地震是海底遗址引发的，目的是永远隐藏自己，不被人发现。
地震结束之后，池田村正心存侥幸，派出无人潜航器，探测海底遗址和海底森林，结果发现，海底森林和海底遗址都被掩埋了。
投入了巨大人力物力的海底遗址考察行动，终于在不可抗拒的力量面前宣告结束。
在整个考察行动中，扶桑国、东国、海神佣兵团、方舟同盟和无名组织全部卷入其中，大量人员死亡，损失惨重。
海神佣兵团拿到了唐巍录下的影像资料，成为了唯一的赢家。方舟同盟和扶桑国拿到了唐巍叙述的探测过程，也算有所收获。
考察行动无奈结束，各方默默退场。
最开始参加遗址考察的藤原雅正等考古学家，在被扶桑国军方下达“封口令”之后离开。
中年船长等方舟同盟的人悄然离开，没有找海神的麻烦。
无名组织和东国势力销声匿迹，不知道是不是在谋划下一次行动。
包括唐巍在内的海神众人也在三叉戟的带领下返回基地，这次海底遗址考察行动耗时超过四个月，这是唐巍第一次参加耗时这么长的行动，他回到基地的时候，蓝珊的伤已经完全好了，行动自如，和原来没什么两样。
几个月没见到蓝珊，唐巍真的很想她，他兴高采烈地去看她，没想到蓝珊对他很平淡，神态举止没有半点喜色，也没有说什么特别的话，只是随口说了几句“回来就好”之类的话。
唐巍本以为蓝珊能像他一样高兴呢，见到她如此平静有些失望，不过转念一想，她虽然对他冷漠，可在关键时刻却能舍命相助，她为了他都能舍弃性命，他又有什么好抱怨的呢？
至于水藻、孤城那些受伤的同伴，此时也全都养好了伤，他们见到唐巍倒是非常热情，说要带唐巍四处游玩，不过“找乐子”的事情一时间没有人提起，他们觉得提到这种事情，会让唐巍想起天羽佳纯，勾起他的伤心往事。
回到基地之后，录像带就再无消息，三叉戟和波塞冬对录像带的事情秘而不宣，连唐巍这个亲历者也不透露分毫。
海底遗址的秘密一直缠绕在唐巍的心头，在三万年前，究竟是谁有这样的能力，研发出如此强大的科学技术，拥有如此科学技术的人，又去了哪里？水下正六边形空间里那段奇异的影像，又是什么意思？